Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

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Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ttc39aA2ACP1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ttc39aA2ACP1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ttc39aA2ACP1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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