Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rbbp8nlA2ABX0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms