Protein–RNA interactions for Protein: A2A9G7

Shisal2a, Protein shisa-like-2A, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal2aA2A9G7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Shisal2aA2A9G7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms