Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cul4bA2A432 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cul4bA2A432 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms