Protein–RNA interactions for Protein: A2A3V1

Akap17b, A-kinase anchor protein 17B, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Akap17bA2A3V1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Akap17bA2A3V1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms