Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms