Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ubl3Q9Z2M6 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms