Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mbd1Q9Z2E2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms