Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3b1Q9Z1T1 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3b1Q9Z1T1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms