Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms