Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Shcbp1Q9Z179 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Shcbp1Q9Z179 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms