Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cog1Q9Z160 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms