Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx1Q9WV80 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms