Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

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Length 854 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sh2d3cQ9QZS8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Sh2d3cQ9QZS8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Sh2d3cQ9QZS8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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