Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ7

Nr2e3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2e3Q9QXZ7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Nr2e3Q9QXZ7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nr2e3Q9QXZ7 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms