Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cbx8Q9QXV1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms