Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Col5a3Q9JLI2 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Col5a3Q9JLI2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Col5a3Q9JLI2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Col5a3Q9JLI2 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col5a3Q9JLI2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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