Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Arl6ip1Q9JKW0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Arl6ip1Q9JKW0 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms