Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trem1Q9JKE2 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Trem1Q9JKE2 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trem1Q9JKE2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trem1Q9JKE2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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