Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smad9Q9JIW5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Smad9Q9JIW5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms