Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Lmbr1Q9JIT0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lmbr1Q9JIT0 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms