Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus3Q9JI38 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus3Q9JI38 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms