Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Timp4Q9JHB3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Timp4Q9JHB3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms