Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
OtofQ9ESF1 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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