Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Slc28a3Q9ERH8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Slc28a3Q9ERH8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms