Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MesdQ9ERE7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms