Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tfip11Q9ERA6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms