Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Cxcr6Q9EQ16 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms