Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SgshQ9EQ08 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms