Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rpgrip1Q9EPQ2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rpgrip1Q9EPQ2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms