Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tlr1Q9EPQ1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms