Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl4Q9DCU6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl4Q9DCU6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms