Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Abcg8Q9DBM0 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms