Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB85

Rrp8, Ribosomal RNA-processing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp8Q9DB85 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rrp8Q9DB85 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Rrp8Q9DB85 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rrp8Q9DB85 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rrp8Q9DB85 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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