Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Znf580Q9DB38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Znf580Q9DB38 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
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Znf580Q9DB38 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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Znf580Q9DB38 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Znf580Q9DB38 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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