Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rsph3bQ9DA80 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms