Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cnot8Q9D8X5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms