Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Capn9Q9D805 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Capn9Q9D805 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms