Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6T1

Tube1, Tubulin epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tube1Q9D6T1 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tube1Q9D6T1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms