Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q8

Uncharacterized protein C1orf141 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D5Q8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Q9D5Q8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms