Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rabl3Q9D4V7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rabl3Q9D4V7 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms