Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S9

4931428L18Rik, RIKEN cDNA 4931428L18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931428L18RikQ9D4S9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
4931428L18RikQ9D4S9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
4931428L18RikQ9D4S9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms