Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4S4

4930564D02Rik, RIKEN cDNA 4930564D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930564D02RikQ9D4S4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
4930564D02RikQ9D4S4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
4930564D02RikQ9D4S4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms