Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trappc6bQ9D289 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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