Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1P4

Chordc1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chordc1Q9D1P4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chordc1Q9D1P4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Chordc1Q9D1P4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms