Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Mrpl28Q9D1B9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Mrpl28Q9D1B9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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