Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ift27Q9D0P8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Ift27Q9D0P8 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms