Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nde1Q9CZA6 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Nde1Q9CZA6 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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