Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnih4Q9CX13 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms