Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Pfdn1Q9CWM4 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Pfdn1Q9CWM4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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